婴儿的免疫系统尚未发展成熟，容易受病菌感染。病菌可经由食物传播，所以婴儿奶瓶和奶嘴必需彻底消毒。
消毒前的准备
消毒之前，先要将每件器具清洗干净。这个步骤非常重要，因为奶瓶、奶嘴只有在清洗干净后才能彻底消毒。简单的冲洗并不足够，因为极微细的食物残渣，都可能成为病菌繁殖的温床。
以下是我们建议的最佳处理程序：
- 餐后将奶瓶、奶嘴及配件彻底洗净
- 将奶嘴里外洗刷干净
- 再用清水冲洗干净。需要特别留意清洗奶嘴孔，并用水冲过洞孔，确保没有食物残余。
- 所有器具最少每天消毒一次，最好在早上进行
- 所有器具都清洗干净后便可进行消毒
沸水消毒
沸水消毒是一种有效杀死病菌的方法，父母经常会在卫生、消毒的过程中遇上困难。一般建议将奶嘴放在沸水里煮两至三分钟消毒，但是，很多父母都不容易掌握住恰当的时间，不是煮得时间过长，要不就是时间过短。
奶嘴不应煮得太久，这样会令表面黏性增加，出现细孔，加速物料老化。如果器具没有完全浸泡在水中，或表面积聚气泡，结果就会跟煮沸时间不足时一样。这样或许可以减缓物料老化，但是，却不能彻底且有效的杀死病菌。
- 先将清水煮沸，再放入要消毒的奶瓶和奶嘴
- 确保所有器具都完全浸泡在水中
- 确保锅里有足够清水
- 器具煮两至三分钟已经足够
- 消毒时一定要有人在场，以免发生危险
蒸汽消毒
使用蒸汽消毒锅是最好的消毒方法，更对环境无害。
水蒸汽能有效杀死病菌，无需加入任何化学品。奶瓶、奶嘴上不会残留化学品，不会影响婴儿健康。也因为减少使用化学品，更有助保护环境。您只需要使用蒸汽消毒锅以及普通自来水(或蒸馏水便可)。
蒸汽消毒锅消毒是最简单方便的方式。
以下是我们建议的最佳处理程序：
- 先彻底清洗奶瓶、奶嘴和旋转盖
- 将奶嘴里外洗刷，并用清水冲洗干净
- 将70ml的水倒入发热底盘
- 将奶瓶放进下篮框，瓶口朝下，其他细小配件如奶嘴、旋转盖等可放进上篮框，将上下篮框叠起。盖上盖子，轻按启动按钮。
- 当中由水变成之蒸气可达95-97°C，足以杀灭有害细菌。
- 蒸气亦会从四周均匀地蔓延并进行消毒程序。消毒过程完成后，清毒锅之指示灯会自动关掉。(约12分钟)
蒸汽消毒方法在一般家庭仍未被广泛使用。但数十年以来，医院每天都使用类似的方法消毒器具，成效显著。传统的沸水消毒法会令奶嘴表面黏性和洞孔增加，已经不合时宜了。
使用蒸汽消毒，不但令奶嘴更持久耐用，奶瓶上的图案也能更有效地保存。所有器具都可存放在消毒锅内，既卫生，又无尘。随锅附赠的奶瓶夹可避免用手直接接触器具，减少污染。